Convertire gli URL relativi in URL assoluti è semplice con jQuery.
La soluzione è la seguente:
$( "a" ).each(function() {
var $a = $( this ),
href = $a.attr( "href" );
if( /^\//.test( href ) ) {
var url = "http://" + location.host + href;
$a.attr( "href", url );
}
});