Ci sono in giro false voci sul sorpasso di jQuery ai danni di Flash, ma queste voci probabilmente si riferiscono alle statistiche d'uso e non alla superiorità di jQuery nei confronti di Flash. Per quanto riguarda animazioni ed effetti, Flash resta ancora il modello a cui ispirarsi e sicuramente è superiore a jQuery per molti aspetti. Le animazioni Flash non dipendono dal browser, ma vengono eseguite tramite l'apposito interprete. Per questo motivo sono esenti da quegli sfasamenti e da quelle imperfezioni che invece spesso troviamo nelle animazioni jQuery, le quali dipendono interamente dal supporto del browser. Questo significa che solo i browser più moderni e performanti riescono ad eseguire animazioni ed effetti jQuery in modo fluido e piacevole a vedersi. Tutti gli altri mostreranno dei rallentamenti o dei bug più o meno evidenti. Quindi chi pensa che con jQuery si possano ottenere gli stessi risultati che si ottengono con Flash o non conosce bene jQuery o non conosce affatto Flash.